Jakub Klecker patří mezi nejrychleji se profilující české dirigenty. Od roku 2004 je umělecky spjat se souborem Janáčkovy opery Národního divadla Brno, kde pod jeho taktovkou vznikly desítky úspěšných inscenací. V letech 2015–2020 působil jako hudební ředitel opery Národního divadla moravskoslezského. Za zmínku stojí i jeho úspěšné působení na pozici šéfdirigenta Moravské filharmonie Olomouc v letech 2019–2022. V roce 2013 dirigoval Verdiho Aidu ve Státním divadle v Norimberku. Při účinkování brněnské Janáčkovy opery v Ománu v květnu 2014 řídil Dvořákovu Rusalku. V roce 2017 debutoval s Mozartovou operou Figarova svatba ve Wroclavské opeře.
Jakub Klecker také spolupracuje s většinou českých a slovenských orchestrů. V letech 2007 a 2009 vedl Filharmonii Brno na koncertním turné po Japonsku. Opakovaně vystoupil na Mezinárodním operním a hudebním festivalu Janáček Brno, Smetanova Litomyšl či Rheingau Musik Festival. V letech 2009, 2016 a 2024 dirigoval na festivalu Pražské jaro. Na podzim roku 2019 dvakrát hostoval ve Zlatém sále vídeňského Musikvereinu (Moravská filharmonie Olomouc a Filharmonie Bohuslava Martinů Zlín).
Od roku 2014 působí jako pedagog na brněnské Janáčkově akademii múzických umění, od roku 2022 je zde docentem a vedoucím Katedry dirigování a operní režie. Jakub Klecker vystudoval dirigování u Jiřího Bělohlávka a Tomáše Koutníka na pražské HAMU.